Na de catastrofale gebeurtenissen in New York met de Avengers leidt Steve Rogers, alias Captain America, een rustig leven in Washington D.C. Maar wanneer S.H.I.E.L.D. wordt aangevallen raakt hij verwikkeld in een web van intriges dat een bedreiging vormt voor de toekomst van de mensheid. Terwijl het complot in alle hevigheid toeneemt en alle hoop vergaat, moeten Captain America, Black Widow en de Falcon hun krachten bundelen om het meest mysterieuze en krachtige wapen van hun kwaadaardige vijand te bestrijden - de Winter Soldier.